A estrutura organizacional do Karanba conta com a seguinte formação:
- Administração e operacional: gestão da organização, manutenção e conservação do espaço, direcionamento das ações diárias dos profissionais envolvidos no setor.
- Desenvolvimento Humano: equipe formada por psicólogo, pedagogo, socióloga e assistente social a fim de atender os beneficiários e seus familiares.
- Educacional: time responsável pela parte pedagógica dos projetos, organizando aulas, elaborando conteúdo para cursos, mapeando os alunos e encaminhando para oportunidades profissionais.
- Futebol: equipe que realiza o planejamento esportivo através dos treinamentos diários oferecidos na sede em diversas categorias.
- Comunicação e Marketing: responsável por alimentar as sedes sociais, atender a imprensa, promover as ações do projeto e demais iniciativas ligadas ao setor.